复旦大学附属中山医院放射治疗（简称：放疗）始于1947年，有78年历史，于1996年独立建科。建科时位于西院区12号楼，仅有2台直线加速器的机房。经过近30年的不断发展，目前科室空间、设备和人员素质都有巨大进步。至2024年，放疗科在总部已配置4台直线加速器、3台TOMO刀、1台射波刀、1台术中放疗、1台内放疗后装机（即将开展）以及与这些大型放疗机器相配套的辅助系统，在厦门分院有2台直线加速器。放疗科拥有一支结构合理、专业技术训练良好、经验丰富的专业医技人员队伍，总部正式员工108人，其中医生36人、物理师24人，技术员48人；厦门分院医生6人、物理师3人、技术员7人。作为国内一流大学的附属医院，复旦大学附属中山医院放疗科医、教、研并重，是国家临床重点专科建设科室，硕士、博士培养点，诊疗技术在国内外始终保持领先水平，目前年放疗肿瘤病人超过6500例。