中山医院于1950年，在著名的麻醉科教授吴珏带领下成立血库，当时隶属麻醉科管理；上世纪70年代，由于主要工作为血型检测、配血及发血，遂归并入检验科；2007年，依照国家相关规定正式成立独立的输血科并定义为临床科室。 从血库的组建到今天输血科独立，七十多年风风雨雨，几代人辛勤耕耘，科室经历了由简单“配配血、发发血”的手工检测和操作为工作业务的血库，发展为集临床、检验、管理职能于一身，自动化和信息化建设完备，医教研全面发展的与大型综合性研究型医院相匹配的输血科。特别是近十多年来，在现任主任戎瑞明教授的带领下，创新优化安全管理模式，科室内部设置质量管理、科研管理、教学管理、设备管理、耗材管理等关键岗位。科室在编工作人员15人，其中，博士2名，硕士6名；主任医师1名、副主任技师1名、主治医师2名、主管技师5名，技师5名。大学本科以上学历占93％。输血科的所有工作均严格遵照2012年8月1日卫生部公布的《医疗机构临床用血管理办法》条例执行，为加强医疗机构临床用血管理，推进临床科学合理用血，保护血液资源，保障临床用血安全和医疗质量。 　　科室主体位于西院区1号楼2楼，另在东院区16号楼4楼设立服务于心外科和肝外科手术室的配血、发血的点。科室内设有输血科实验室总面积260余平方米。2008年，医院引进国内第一条血液专用输送轨道。科室拥有全系列血型鉴定和配血自动化分析平台（伯乐IH100、戴安娜WADIANA、奥森多AUTO），同时，拥有垂直层流超净工作台、生物安全柜、移动式紫外线消毒车、储血冰箱、储血冰柜、血浆解冻箱、血小板保存箱、水浴箱、BASO离心机等大型设备。 　　2017年复旦大学附属中山医院厦门医院开业，输血科秉承“严谨、求实、团结、奉献、创新、关爱”的院训，融合上海、厦门不同用血模式，建立厦门医院的用血管理制度和管理程序并且张贴告知，实行中山厦门医院同质化管理。期间参加金砖会议保障工作，有序开展各项检测并提供各种血制品。 　　 　　输血科室始终将“输血安全”作为基本原则，将提高质量和服务作为工作重点。输血科全体同仁秉承“一切为了病人“的中山精神，以质量为中心，以质量求发展，加强院内外交流与合作，在输血医学2016年被列为国家二级学科的新形势下，抓住发展机遇，夯实基础，勇于创新，再铸辉煌。